专题文章
二、用于RNA测序试验的新型人工拼接基因内部参照物
Jun 30, 2020
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RNA-seq可用于组装各种拼接异构体(spliced isoform),对基因表达情况进行定量研究,对整个转录组(transcriptome)进行宏观研究等。然而,转录组的大小和多样性、基因表达量的差异,以及RNA-seq技术本身的技术限制等因素,都会影响RNA测序结果的质量。为此,我们开发了一套人工RNA标准品,名为“测序spike-in(sequenci...
一、使用人造DNA片段检测多种基因组变异
Jun 30, 2020
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我们开发了一套人工合成DNA标准品(synthetic DNA standard),目前,称之为“sequins”,以此来模仿人类基因,同时还可以用作基因组测序工作中的定性和定量spike-in对照(spike-in control)。
二、Spike-in对照——全基因组分析中被忽视的重要一员
May 28, 2020
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在全基因组范围内对基因表达、转录调控、组蛋白修饰、基因拷贝数变异和核小体定位等进行研究,已经是当代很多实验室的标准研究流程了,这一整套分析也会获得大量与人体健康和疾病有关的数据和信息。不过,其中绝大部分研究都忽视了需要引入spike-in对照(spike-in control)才能开展的标准化问题(normalization)。下文...
一、新一代测序技术的参照标准
May 28, 2020
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目前,如何解读新一代测序技术产生的数据仍是一个大问题,这主要是因为基因组的规模太大,又非常复杂,而且在整个测序工作流程(比如样品的制备、测序、后续数据解读等)中还存在技术误差(technical error)。但是利用参照标准(reference standard),可以发现并减少这些误差带来的影响。所谓参照标准,指的就是由明确...
四、与其他病毒的比较及未来研究的方向
Apr 29, 2020
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人类冠状病毒(HCoV)在过去被认为是相对无害的呼吸道病原体。但在严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS),以及此次的新冠肺炎(COVID-19)爆发后,HCoV作为呼吸道感染的重要病原体受到了全世界的关注。
三、2019-nCoV/ SARS-CoV-2感染的预防及控制
Apr 29, 2020
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鉴于目前还没有针对新冠病毒的特效药物和疫苗,通过隔离来控制疾病传播,预防病毒感染是能采取的最有效的措施。自疫情出现以来,新冠病毒的来源和演变一直吸引着人们的关注,如果能清楚病毒在物种间传播的历史和途径,以及病毒在人际传播的特点和机制,将有效提升人们对病毒的防御能力。已有多项研究表明该病毒可能源于...
二、关于COVID-19诊断和治疗的相关研究
Apr 29, 2020
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根据各项研究报道,COVID-19患者的典型临床症状是发热、干咳、呼吸困难、头痛和肺炎,早期病例中有一定比例的患者接触过华南海鲜市场,但随后该病已发展为人传人,即通过飞沫和接触传播。该病的发生可导致肺泡损伤引起的进行性呼吸衰竭,甚至死亡。
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