专题文章

二、用于RNA测序试验的新型人工拼接基因内部参照物

Jun 30, 2020 No Comments
RNA-seq可用于组装各种拼接异构体(spliced isoform),对基因表达情况进行定量研究,对整个转录组(transcriptome)进行宏观研究等。然而,转录组的大小和多样性、基因表达量的差异,以及RNA-seq技术本身的技术限制等因素,都会影响RNA测序结果的质量。为此,我们开发了一套人工RNA标准品,名为“测序spike-in(sequenci...
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一、使用人造DNA片段检测多种基因组变异

Jun 30, 2020 No Comments
我们开发了一套人工合成DNA标准品(synthetic DNA standard),目前,称之为“sequins”,以此来模仿人类基因,同时还可以用作基因组测序工作中的定性和定量spike-in对照(spike-in control)。
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二、Spike-in对照——全基因组分析中被忽视的重要一员

May 28, 2020 No Comments
在全基因组范围内对基因表达、转录调控、组蛋白修饰、基因拷贝数变异和核小体定位等进行研究,已经是当代很多实验室的标准研究流程了,这一整套分析也会获得大量与人体健康和疾病有关的数据和信息。不过,其中绝大部分研究都忽视了需要引入spike-in对照(spike-in control)才能开展的标准化问题(normalization)。下文...
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一、新一代测序技术的参照标准

May 28, 2020 No Comments
目前,如何解读新一代测序技术产生的数据仍是一个大问题,这主要是因为基因组的规模太大,又非常复杂,而且在整个测序工作流程(比如样品的制备、测序、后续数据解读等)中还存在技术误差(technical error)。但是利用参照标准(reference standard),可以发现并减少这些误差带来的影响。所谓参照标准,指的就是由明确...
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四、与其他病毒的比较及未来研究的方向

Apr 29, 2020 No Comments
人类冠状病毒(HCoV)在过去被认为是相对无害的呼吸道病原体。但在严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS),以及此次的新冠肺炎(COVID-19)爆发后,HCoV作为呼吸道感染的重要病原体受到了全世界的关注。
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三、2019-nCoV/ SARS-CoV-2感染的预防及控制

Apr 29, 2020 No Comments
鉴于目前还没有针对新冠病毒的特效药物和疫苗,通过隔离来控制疾病传播,预防病毒感染是能采取的最有效的措施。自疫情出现以来,新冠病毒的来源和演变一直吸引着人们的关注,如果能清楚病毒在物种间传播的历史和途径,以及病毒在人际传播的特点和机制,将有效提升人们对病毒的防御能力。已有多项研究表明该病毒可能源于...
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二、关于COVID-19诊断和治疗的相关研究

Apr 29, 2020 No Comments
根据各项研究报道,COVID-19患者的典型临床症状是发热、干咳、呼吸困难、头痛和肺炎,早期病例中有一定比例的患者接触过华南海鲜市场,但随后该病已发展为人传人,即通过飞沫和接触传播。该病的发生可导致肺泡损伤引起的进行性呼吸衰竭,甚至死亡。
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一、2019-nCoV /SARS-CoV-2基因组相关研究

Apr 29, 2020 No Comments
新冠疫情爆发以来,Peng Zhou等人的研究首次详细报道了2019-nCoV,提出2019-nCoV可能是导致武汉地区急性呼吸综合征流行的病因。虽然当时2019-nCoV与该病之间的关联尚未通过动物实验得到证实,并完全符合科赫法则,但在所有受试患者中观察到的病毒核酸阳性和病毒蛋白血清转化提供了两者之间关联的证据。
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