空间组学探索肿瘤微环境的分子地理学
肿瘤微环境是一个由正常细胞和癌细胞、分子和血管组成的复杂混合体。
绘制组织样本中分子分辨率的图谱的方法正在改变癌症研究，但这些工具的复杂性可能会让初学者望而生畏。
对癌症患者来说，肿瘤看起来就像无序的缺陷细胞团块，无情地专注于无限制的生长和侵袭。但这并不意味着它们是均质的。癌细胞具有广泛的突变，其生长包含健康的宿主细胞、血管、免疫细胞和恶性细胞，肿瘤是这些成分进行战斗的微观战场。
直到大约十年前，研究人员还没有足够的技术来探索这种肿瘤微环境。但是，能够在空间上绘制大量生物分子（如RNA和蛋白质）的工具的出现，引发了一场革命。事实上，研究人员正越来越多地将这些信息层叠整合，以创建丰富的“多组学”空间地图，从而可以对不同的细胞类型进行分类，并探测它们在肿瘤中的活动。
澳大利亚布里斯班昆士兰大学（University of Queensland）的癌症生物学家Arutha Kulasinghe指出，他们不再只是谈论肿瘤的异质性，他们可以直观地看到它。他们可以直接在组织上看到一些耐药性、敏感性和不同的生物学特征。促进致癌和疾病进展的空间因素也越来越明显，揭示了肿瘤发生发展过程中的潜在脆弱性。这可能会改变癌症研究和病理学，从而以前所未有的复杂程度对肿瘤进行建模、解释甚至预测。
但进入这一领域的门槛很高。空间组学分析的技术平台很多，实验成本高，操作复杂。即使有了数据在手，癌症研究人员可能面临一段漫长的、学习计算的旅程，才能正确理解数据。马里兰州巴尔的摩约翰霍普金斯医学院（Johns Hopkins Medicine）的生物信息学家Elana Fertig表示，每个人都想要他所说的多组学的‘混合理论’——即你把所有的数据集放在一起，它会告诉你其中的答案。他越来越相信这是不可能的，因为每个人想问的问题都不同。
