泛基因组学正当时
Apr 25, 2023
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长读系统更容易将给定的序列匹配到对应的染色体。
名为泛基因组的多基因组组合可以捕获一个物种的遗传多样性,但研究人员仍在研究如何最好地构建和探索它们。
“参考”一词传达了权威,意味着可以用其作为依据来评估新信息。百科全书和地图集都是如此,参考基因组——描述物种染色体DNA完整序列的超高精度地图——也是如此。
但是,个人参考基因组在提供真实世界的生物蓝图方面做得不太好,这是一个公开的秘密。据位于珀斯的西澳大利亚大学(University of Western Australia)的生物信息学家David Edwards回忆,一位同事曾想用一种被充分研究过的单一菌株来研究小麦变体的基因表达。Edwards表示,他们已经证明,在商业小麦品系中有大约2万个基因没有被包含在参考基因组中。除非你考虑到参考基因组的局限性,否则你会错过很多信息。