预测患重症COVID-19几率的DNA测试受到审查

有些人在冒险进入人群之前可能想知道他们对重症COVID-19的易感性。

预测患重症COVID-19几率的DNA测试受到审查

怀疑论者认为，基因和风险之间的关系是不确定的

对于尚未接种COVID-19疫苗或仍对冒险进入人群感到紧张的人来说，这种销售宣传可能很诱人：向试管里吐口水来提供你的DNA并且将其邮寄出去，看看你有多大可能成为最终因SARS-CoV-2感染而入院或死亡的那10 %到15 %的人之一。这就是一家澳大利亚公司上周在美国推出的175美元测试的承诺。它将基因组数据与某人的年龄、性别和预先存在的医疗状况结合起来，预测他们患重症COVID-19的风险。

该公司利用英国数千名COVID-19患者的数据开发了其测试。它可能是类似风险测试的先驱。一个学术团队最近详细介绍了一种更简单的基因测试，以帮助确定一些感染SARS-CoV-2的人应该如何积极地接受治疗。

然而，几位遗传学专家警告称，一个人的基因如何影响COVID-19的进程仍然很复杂，以至于无法部署这种风险评估。约翰霍普金斯大学（Johns Hopkins University）的遗传流行病学家Priya Duggal表示，用基因测试来预测一个人可能的COVID-19的严重程度还为时过早，因为我们不了解这些基因变异的确切含义以及它们如何影响疾病。

Duggal和其他人还表示，在美国大多数人都能获得高效力的COVID-19疫苗的时候，该公司的测试可能毫无意义，甚至可能成为阻碍人们接种的因素。该测试的开发者、位于墨尔本的遗传技术公司（Melbourne-based Genetic Technologies）的首席科学官Richard Allman强调，人们应该接种疫苗。但他表示，在免疫力形成之前和之后以及在免疫力减弱之后，该测试可能是有用的。

该公司借鉴了对数千名COVID-19患者的基因组进行梳理的研究，寻找被称为单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNPs）的常见DNA碱基差异。例如，这些基因变异可能会影响一个人对病毒的抵抗力，或对致命免疫过度反应的易感性。一项名为“COVID-19宿主遗传学倡议”（COVID-19 Host Genetics Initiative）的全球数据收集工作已经发现了几十个SNP与感染者发展成重症COVID-19的较高风险之间的初步联系，从加倍到小幅增加，例如从15 %风险到增加到16 %。

遗传技术公司在利用英国生物库（UK Biobank，是一个主要由50至84岁的英国白人居民组成的研究数据库）评估了候选标记后将其中的7个SNP纳入了一项测试。该公司将生物库中约2200名曾因COVID-19住院的参与者与5400名感染后症状轻微或未患病的人进行了比较。该测试还考虑了COVID-19的风险因素，如老年、男性、肥胖或糖尿病。

该公司在3月的一份预印本中得出结论，基于SNP的结果在预测能力上比单纯使用年龄和性别有“实质性的提高”。该公司的模型表明，虽然50岁或以上的人因冠状病毒感染严重疾病的平均风险为27 %，但对于某些50岁以上的人来说，该风险低至4 %。遗传技术公司（Genetic Technologies）的生物统计学家Gillian Dite表示，而对其他人来说，风险“真的非常高”—高达98 %，这意味着一个未接种疫苗的人感染SARS-CoV-2后，几乎一定会发展成重症的COVID-19。

然而，该测试在监管灰色地带首次亮相。澳大利亚公司及其美国合作伙伴Infinity Biologi （IBX）没有寻求美国食品和药物管理局（Food and Drug Administration）对其有效性的批准，因为Allman表示，该测试不是一个需要该机构审查的直接面向消费者的产品。在客户收到来自IBX联邦批准的实验室的结果后，他们可以向 “远程医疗”医生咨询。

几位审查了该公司预印本的遗传学家警告，该测试需要在其他更多样化的人群中进行审查，也许还需要对新的SARS-CoV-2变异体进行审查。美国国家癌症研究所（U.S. National Cancer Institute）的癌症遗传学家Stephen Chanock表示，这是一个良好的开端，但它绝不是经过了充分的校准或验证，以说明这是我愿意或我妻子应该接受的测试。

Dite表示，很难找到包含COVID-19患者临床信息的大型数据集来进行额外的验证，因此该公司推进了“因为对该大流行病作出快速反应的重要性”这项测试。该测试询问某人是否有非欧洲血统，这似乎会增加重症COVID-19的风险，所以她认为这与美国少数民族有关。

COVID-19宿主遗传学计划（COVID-19 Host Genetics Initiative）的成员提议仅用3号染色体上的一个SNP来预测60岁以下寻求医疗护理的受感染者严重疾病的风险，该小组在3月的一份预印本中报告称，拥有这个SNP的一个拷贝会使一个人患严重疾病的风险提高2.6倍。

马萨诸塞州综合医院（Massachusetts General Hospital）的医生科学家Amit Khera认为，即使这种简单的SNP测试也可能不会很快发现其医疗用途。他指出，几乎没有医生或急诊室工作人员给病人做快速基因测试以指导治疗的实例。

尽管如此，许多遗传学家，包括Chanock，他自己也在寻找COVID-19的遗传风险因素，并且认为这种工具是值得开发的。但是，他指出，像这样的测试如何以及以何种方式发挥作用仍然属于开放性问题。

原文检索：
Jocelyn Kaiser. (2021) DNA test to predict odds of severe COVID-19 draws scrutiny, Science, 372(6547): 113.
郭庭玥/编译