首页  >  专题文章  >  文章正文
shRNA表达克隆

六、新一代测序技术的展望

Feb 28, 2013 3 Comments

1. 第三代测序代表性平台简介

2. 第三代测序技术带来的改变与展望

3. 最新测序概念性研究状况与展望

专题文章

3 Responses to “六、新一代测序技术的展望”

  1. 王志民 says:

    据我所知,Helicos已与2012年底申请破产保护。VisiGen技术被收购后改名Starlight,Life Tech已于2011年2月终止了将Starlight的商业化。

  2. 王志民 says:

    一时高兴,把我所知道的与大家分享一些。

    测序技术世代的划分:在测序技术界,除了Sanger测序被公认为第一代技术外,其他世代的划分并不统一,但多数人认为,除Sanger以外的所有需要经扩增再测序的统称为第二代测序技术(目前主要有Life Tech的SOLiD系列、Ion Torrent PGM和Ion Torrent Proton;Illumina的HiSeq序列、MiSeq和Genome Analyzer序列;罗氏公司的Roche/454 GS FLX和Junior),以单分子为底物的称为第三代测序。Complete Genomics的纳米球是经滚环复制的产物,严格讲,属于二代测序技术,目前,华大基因正在收购CG。无论第几代,对测序技术的要求有公认的四项黄金标准,即准确率、通量、读长和费用,本人还增加了一个标准,就是直读被修饰的碱基,如脱氧胞苷甲基化和羟甲基化等。

    正在浮出水面的测序仪公司(从事测序方法研究的人太多,略):
    GnuBio的杂交测序,是基于哈佛大学David Weitz的工作,用皮升(10-12升)量级的液滴测序,为台式测序仪,大小约40 cm x 50 cm x 30 cm,预将人类基因组测序的耗材费用降到$30。但是不是单分子测序,还没有信息报道。2012年二季度,公司计划给选好的早期用户发货4台测试系统,接下来到年底推出商业化系统。PicoSeq 公司也采用杂交测序,是单分子测序。

    2012年,在美国佛罗里达马可岛召开的AGBT(Advances in Genome Biology and Technology)大会上,Oxford Nanopore Technologies声称下半年要推出其MinION测序仪,2013年推出GridION,15分钟测序一个人的基因组。但在2013年的AGBT大会上,ONT代表保持了沉默,没有实现去年AGBT大会所期待的商业化进程。

    预将纳米孔测序技术商业化的公司主要有Genia、Quantapore和Electronic BioSciences,Stratos Genomics Inc.则采用“扩展测序,”但这几个公司的文章不多。NobleGen采用的是A. Meller研制的纳米孔与FRET结合的测序技术,试图在20分钟测序30倍的人类基因组。Nabsys采用的是布朗大学凌新生建立的基于杂交的纳米孔测序,正准备商业化。2011年,Roche与IBM等合作,将晶体管、DNA控速技术和Lindsay小组的碱基识别技术结合,希望在2012年有原型机,2015年有展示设备。

    采用实时合成测序的除Life Tech的Starlight和PacBio的ZMW(灵模波导)为实时测序外,还有位于台湾新竹市的Cracker。

  3. cyq says:

    谢谢你的分享,很有参考价值。

Leave a Reply


eight × 3 =