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shRNA表达克隆

(六) 高通量表型分析

Mar 24, 2010 No Comments

16自动化评估模式生物表型方法的不断发展将会使探索生物学领域未开发之处女地成为可能。

如果你测出感兴趣的生物的全基因组序列,发展出研究基因组的新技术并构建出功能获得或功能缺失的基因突变体文库,那么下一步该做什么呢?尤其是如果你倾向于进行全基因组层面的研究,或进行经典突变和正向遗传性研究,你就需要一个更精确、更快速、更可靠的方法来鉴定靶基因调节或敲除后表型的改变。

过去十多年,许多大规模研究工作都是通过复杂的手工操作完成的,这都归功于精巧的表型检测实验设计和科学家的勤奋敬业。毫无疑问,自动或半自动化的表型研究方法的不断发展将使以前不可能的任务成为可能。

事实上,一些研究人员正致力于将其它领域的相关技术引入模式生物表型研究。单单在《自然-方法》(Nature Methods)杂志上就发表了数篇相关的新方法,这些方法使基于计算机进行表型判断成为现实,而这些细微的表型改变过去是无法被人眼发现的。

研究活体内细胞位置、细胞谱系、荧光报告基因表达等在光学显微镜下的变化也可以通过自动化实现。如果没有自动化、没有大规模的数据处理,那么这些研究是无法完成的。
当然这些方法投入使用后,相应的问题自然会浮出水面,但随之也必然会被加以完善。只要还有人们感兴趣的表型未被研究透彻,新方法就必然会不断涌现。

 

原文检索:Natalie de Souza. (2010) High-throughput phenotyping. Nature Methods 7(1): 36.
董云巧/编译

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